Коралина Джонс скучает в своем новом доме, пока не находит запертую потайную дверцу. Когда она все-таки открывает ее, то попадает в зеркальный мир, такой же, как ее собственный, но куда лучше. Здесь живут ее Другие родители - они невероятно внимательны, веселы и готовы исполнять любое ее желание. Правда, у всех в этом мире, включая соседей мисс Спинк и мисс Форсибл, а также циркача мистера Бобо, вместо глаз пришиты черные пуговицы.
Сначала Коралина в восторге от этого идеального места, но постепенно ее начинает что-то настораживать. Ее Другая мать становится все более навязчивой и требовательной. Она предлагает Коралине остаться в этом мире навсегда, но для этого девочке тоже придется заменить свои глаза на пуговицы. Коралина в ужасе отказывается и пытается вернуться домой, однако дверца-проход обратно захлопывается, а ее настоящие родители таинственным образом исчезают.
Девочка понимает, что попала в ловушку древнего и жуткого существа, которое лишь притворялось любящей матерью. Чтобы спасти своих настоящих родителей и души других похищенных детей, чьи призраки ей помогают, Коралине придется снова отправиться в тот кошмарный мир. Ей предстоит опасная игра в прятки с Другой матерью, где на кону стоит ее свобода и самое дорогое - ее глаза и ее жизнь.
В финальной схватке Коралине удается перехитрить чудовище, освободить пленников и замуровать проход между мирами. Она возвращается в свою, пусть и неидеальную, но настоящую жизнь, где ценит тепло и заботу своих живых родителей. Этот опыт научил ее, что самая яркая и соблазнительная сказка может скрывать за собой самую страшную опасность.